哲学
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生态学
材料科学与工程
环境科学与工程
基础医学
临床医学
中西医结合
药学
中国语言文学类
英语（含复旦-英国曼彻斯特大学“2+2”双学位项目）
俄语
法语
西班牙语
日语
朝鲜语
历史学类
哲学类（含复旦-英国伯明翰大学“2+2”双学位项目）
新闻传播学类（卓越新闻人才计划，含复旦-日本早稻田大学“3+1”、复旦-美国密苏里大学“3+2”双学位项目）
社会科学试验班
法学（卓越法律人才基地，含复旦-美国亚利桑那州立大学“3+2”、复旦-美国杜兰大学“3+1”双学位项目）
经济学类（含数理经济拔尖项目、经济学专业国际项目和复旦-荷兰格罗宁根大学“2+2”双学位项目）
经济管理试验班
数学类（拔尖人才培养计划）
自然科学试验班（拔尖人才培养计划，含复旦-英国伯明翰大学、复旦-美国亚利桑那大学等“2+2”双学位项目）
技术科学试验班（卓越班，含复旦-澳大利亚国立大学“2+2”双学位项目和复旦-加拿大多伦多大学、复旦-比利时鲁汶大学等“3+1+1”本硕连读项目）
工科试验班（新工科本研贯通）
微电子科学与工程（国家示范性微电子学院）
核工程与核技术
智能科学与技术
航空航天类
软件工程（国家示范性软件学院）
保密管理（国家保密学院）
临床医学（8年制本博连读）（卓越医生计划）
临床医学（5年制）（卓越医生计划）
基础医学（拔尖人才培养计划）
法医学
公共事业管理
护理学
护理学（助产士方向）